20世纪50年代的政治运动,主要是抗美援朝、土地改革、镇压反革命三大运动和“三反”、“五反”、整风反右运动。在抗美援朝、土地改革、镇压反革命三大运动中,中直机关党委做了大量、细致的工作,动员广大干部参加运动,使他们受到了深刻的爱国主义教育和阶级教育。在干部、职工中引起较大震动的是“三反”运动和整风反右运动。
1951年12月,中共中央决定在全国范围内大张旗鼓地开展一次“三反”运动。为了统一领导中央直属党政军机关的“三反”运动,12月22日,中央决定成立中央一级机关总党委,任命周恩来为第一书记,安子文为第二书记,杨尚昆为第三书记,萧华为第四书记。这样,杨尚昆除了要抓中直机关的“三反”运动,还要参与指导中央党政军民各机关的“三反”运动。那时毛泽东对“三反”运动抓得很紧,亲自起草指示、批文件,有时一天就批发几个文件。杨尚昆的主要任务是督战。1951年12月31日,中央一级机关总党委召开有党政军群处以上干部几百人参加的扩大会议,杨尚昆在会上讲话,强调要“限期发动”,限1952年1月10日前各单位毫无例外地发动起来,发动不起来的单位,其首长一律撤职。杨尚昆当场宣布撤销军委总参谋部技术部部长的职务,全场为之震动。1952年1月4日,毛泽东在《中共中央关于立即抓紧“三反”斗争的指示》中,肯定了中央总党委召开扩大会议造声势、推动运动的做法,批示“这一经验,供你们参考”。“三反”运动结束时,根据安子文的统计,全国县以上党政机关不包括军队,参加“三反”运动总人数383.6万人,查出贪污分子和犯贪污错误的人120.3万人,占参加“三反”运动总人数的31.4%。这些人中,受到刑事处分的占3.6%,受到行政处分(包括开除公职)的占20.7%,其余75.7%免于处分。在中直机关内,特别是在中央办公厅,运动发展相对稳健。1952年2月25日,中直机关党委向总党委作“打虎”情况报告,强调“打虎”不能只信口供,要算细账,要进行调查核实,对已承认犯罪事实的“老虎”和中小贪污分子要拿出一定力量进行甄别,并进行追赃工作。毛泽东阅后予以肯定,批示:“此件很好,发各同志参考。强调要材料,要证据,普遍推行算大账、算细账,追赃款、追赃物的方法,是目前打虎作战是否能取得完全胜利的关键所在。”